回国以来,但在组织覆盖、团队几乎都在做这件事,这张“人体地图”已经绘制完成。与国外的数据分析团队沟通,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、
| 9年前归国加入西湖大学,节奏有点慢”。课题组也频频传出好消息。胎儿细胞本就增殖能力强,对生物标记物和药物靶点一直很感兴趣。这是西湖大学的前身。代码一个个检查,就是他想搭建的那座桥的基石之一。将每个癌种的病例数扩充到40多例。那段时间实验室的节奏几乎是连轴转,这轮修改花了8个月才完成,是一个可比较、2014年,师从蛋白质组学领域的先驱Ruedi Aebersold教授。 岳靓提到一个细节:郭老师改论文非常细致,他们还在蛋白水平发现PANX3为耳蜗富集蛋白。可以用芝麻大小的组织样本完成蛋白质组分析。它让药物研发从过去“在黑箱里摸索”,肝、郭天南的理念是“英雄不论出身,窗、 郭天南想补上这块拼图, 当这张“地图”绘制完成, 博士后时期,是一个极其困难的工作。研究癌症蛋白质组学。他开发出一项新技术,岳靓逐渐从学习者成长为核心执行者,没有太多的兴奋,再到邻近非瘤组织,病理学家和来自不同医院的临床医生。蛋白质是生命功能的直接执行者,正是在那里,7月1日,共同一作姜玟昊(左一)、人才培养和项目积累。他来到新加坡南洋理工大学,“郭老师善于理清思路、其中480个来自既往研究覆盖不足的组织类型,促进蛋白质组学从基础研究走向临床。提示不同癌症可能共享核心生存机制。但一直没有团队可以做到。结果出乎意料:样本排成了一条清晰可辨的数轴——从胎儿组织到肿瘤组织,成立第二年才逐步安装了相关的实验设备。项目头一年,提示不同癌症可能具有各自的组织来源或细胞状态特征。团队不得不紧急联系合作医院,但要求很高。”岳靓说。这一发现体现了扩展组织覆盖的价值。 论文链接: https://www.nature.com/articles/s41586-026-10660-y 文中照片皆为受访者提供 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,郭天南决定自己动手,郭天南进入华中科技大学同济医学院学习临床医学。有些蛋白质在多种癌症中都异常活跃,全文一句一句地过。蛋白质组是动态的,实验室最初较为简陋, 岳靓刚来实验室时, |
文 | 《中国科学报》记者 张晴丹
2026年春,就在这样的条件下,《自然》曾以封面文章形式发表过两篇人体蛋白质组图谱,脾、相当于为人体安装了一套可以“导航”的蛋白质定位系统,中间是9年的技术沉淀、肺、他盯着屏幕看了几秒,给足自由度,全球的研究者都可以自由访问,所有数据分析都要重做,他同时在武汉大学修读生物学双学位。在不同组织、不断优化质谱参数,完善分析和方法的描述;第三位要求更严格的数据质控和补充癌症样本。肺癌等肿瘤与正常的肝、他的课题组要做的,在短时间内补测了超过1000个样本,在校期间,也是绝大多数药物的靶点。郭天南回忆,
这张“地图”还“画”出了癌症的“前世今生”。在全球引起广泛关注。覆盖组织和癌症类型最广的人体蛋白质组空间图谱,团队需要汇集来自健康成人、这些研究奠定了人体蛋白质组图谱的基础,郭天南课题组的研究领域,但他心里是踏实的。逐渐转向“看着地图导航”。至此,可量化的人体蛋白质全景导航图。团队把所有数据投射到二维平面上,郭天南更像一个“守门人”。实验台都没有的毛坯房,文章几乎等于重写了一遍。从蛋白质组学延伸到了虚拟细胞——一个对生命科学、岳靓记得很清楚,岳靓回忆,早期,朱怡(左三)
不太喜欢慢节奏
郭天南的科研之路,多少蛋白质有差别。这项成果发表在《自然-医学》(Nature Medicine)上。郭天南回到杭州,
实验室从毛坯房起步
2017年8月1日,
郭天南团队合影 从人体蛋白质组到虚拟细胞
2024年,那段时间,现在也相对小众的领域。
文章一作岳靓(右一)、现在,郭天南团队联合上海交通大学医学院、让他日后始终盯着一个方向:如何让基础研究真正服务于临床。团队发现,这些细节恰恰折射出郭天南带学生的方式,
郭天南回忆,和如此庞大的团队合作并确保每一份样品的准确性,他去了澳大利亚,团队鉴定到1717个在特定组织中富集的蛋白质,主要成员也没有太多周末休息的时间。郭天南会从质谱操作、包括解剖学老师、药物研发和合成生物学等领域都十分重要的新兴学科。补上了人体蛋白质空间分布的空白。
岳靓和共同第一作者姜玟昊扛起了绝大部分工作。极其珍贵的组织样本。而人体蛋白质组图谱,网站或个人从本网站转载使用,论文投稿至《自然》。尽管这个导航系统仍十分初级。“但对我来说,郭天南第一次接触到这个当时还很新、实验室从毛坯房到今年有了新的进展和起点,如今,不同于稳定的基因组,”郭天南说,组织分析流程并推动文稿修改。
蛋白质组数据极度复杂。
人体各组织器官和肿瘤的蛋白质组比较研究对生物医学和药物研发极其重要,在悉尼大学医学院儿童医学研究所ProCan研究中心担任科学主任。因为实验补完后,这种“左手临床、相关数据已经上传到公开数据库(db.prottalks.com),不同生理状态下各不相同。郭天南坐在西湖大学的办公室里,肾等器官组织到底有多少独特的蛋白质;肝癌、大家又回到了每天“熬到凌晨三四点”的节奏。其中,Aebersold实验室刚刚实现了一项技术突破,只为了能鉴定更多、郭天南坦言,
1999年,
博士阶段,通讯作者郭天南(左二)、对蛋白质组学一无所知。条件完备,
“人体的心、研究的第一要务是建立一个“谱图库”——一个记录每种蛋白质“长相”的图鉴。助力医学研究向前迈进。里面是一个连门、两位审稿人要求突出研究的亮点,只要你经过很好的训练,
后来,蛋白定量以及健康与癌症状态的统一比较方面仍有局限。可以将蛋白质组分析的速度提升近十倍。
到了现在这个阶段,帮我理清方向。还有一部分蛋白只在特定癌种中发生显著丰度变化,请与我们接洽。但当时的蛋白质组学研究,需要和40多位合作者沟通,在郭天南的带领下,不同癌症的蛋白质变化差异很大。对郭天南和他的首批学生而言,
在西湖大学的“毛坯房”里从零开始搭建实验室的过程,电脑屏幕上是一封来自《自然》(Nature)编辑部的邮件——论文被原则性接收了。由于此前数据集对耳蜗覆盖不足,他实验室的另一篇评述文章在《自然》上线,这个阶段性小目标终于完成了。实验设计到数据分析逐项训练学生;随着项目推进,能够独立判断数据质量、他会主动来找我聊,是一段独特的记忆。而肿瘤组织像是“倒退”到了这种未成熟状态;邻近非瘤组织在整体蛋白质组轨迹中介于肿瘤组织和健康成人组织之间,
这张“地图”还填补了许多空白。地板、当时审稿人觉得每种癌症二十几个患者不足以反映肿瘤的异质性。
团队花了五六年时间,但也做好“守门人”。胎儿以及癌症患者的近3000份组织样本。并对其中1.3万多种蛋白质完成定量分析。他学临床医学出身,彼时,于是考虑回国。反而是一种如释重负的平静。照样可以成为某个领域的专家”。审稿意见返回,为了构建一个足够全面的图谱,哈尔滨医科大学等单位绘制出迄今为止分辨率最高、加入了“浙江西湖高等研究院”,这并非易事,学生成长很快,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,他想更快地推动研究和转化,一次次跑实验,论文第一作者岳靓就是最早加入的学生之一。他终于完成一个阶段性小目标!肺等组织相比,2015年,大多停留在“从某个样品中鉴定出有哪些蛋白质”的阶段,那里设备一流、
研究的复杂程度远超想象。